在政府寻求提高科学技术领域研发投资效率的方案之际，国会未来研究院提出了对政府出资研究机构进行结构重组和组织整合的必要性。随着近期对研究机构间重复支出和研究课题重复问题的担忧日益加剧，有观点指出，需要进行更为系统的组织整顿。
国会未来研究院在11月3日发布的《提高政府研发投资效率的政策方向》报告中强调，当前的政府出资研究机构体制应基于产业需求，围绕国家战略技术进行改组。报告分析认为，现有的政府出资研究机构功能相似，且机构间的角色界定不清，导致研究课题承接竞争过热及重复研究增多。
政府出资研究机构最初作为小型研究所起步，经过独立与分化，发展至如今的规模。然而，在此过程中，由于侧重于以个别机构为中心的领域扩张，而非系统的角色分工，一直存在效率问题和预算浪费的担忧。特别是，遍布全国的政府出资研究机构地方组织数量超过100个，过于泛滥，这一点也被指为问题。
报告建议，将政府出资研究机构制度转变为开放型结构，政府的研究支持体系也应摆脱按技术领域划分的机构中心模式，重组为以国家战略技术为中心的研究项目单位。据解释，这是为了灵活应对快速变化的产业技术环境，并加强与产业界的实质性合作。
此外，报告还包含了关于大学基础研究领域的意见，即应摆脱按课题个别承接的方式，转变为以大学或院系为单位分配研究经费和课题的方式，以提高研究集中度。同时，报告强调，应整合目前分散在各部委的科学技术人才培养事业，以科学技术信息通信部为中心进行重组以提高效率。报告还提出了将针对产业界需求的人才支持，从面向大学转变为直接面向企业的支援方案。
目前，韩国政府的研发投资规模位居世界第四位，但论文等成果指标仅排在第11至12位。因此，在国家政策研究机构层面也提出了这样的认识：相较于单纯扩大投资，更需要通过结构改善和效率提升来实现实质性的成果进步。
这一趋势很可能对未来科技创新政策和政府预算分配产生影响。预计若旨在提高研究成果质量的结构重组讨论正式启动，现有研究机构的组织重新布局和角色调整将不可避免。
